Исследование, проведенное Бристольским университетом и опубликованное в журнале Royal Society Open Science, может помочь проложить путь к повышению продуктивности почв и улучшению здоровья.
Микроскопические организмы играют ключевую роль в функционировании всех экосистем, от круговорота питательных веществ в почвах до защиты кишечника человека. Но охарактеризовать широкий спектр видов, присутствующих в этих средах, чрезвычайно сложно, поскольку большинство методов фиксируют лишь небольшую часть того, что там на самом деле есть.
Первый автор Люсия Николаева-Рейнольдс, выпускница биологического факультета Бристольского университета, сказала: “Микробы правят миром. Хотя они невидимы для нас, они встречаются практически повсюду и играют решающую роль в природе. К сожалению, современные технологии мониторинга микробов ограничены наблюдением лишь за небольшой частью присутствующих. Это приводит к пробелам в наших знаниях о том, как этот скрытый микробный мир поддерживает здоровье экосистем.”
Команда биологов решила эту проблему, перепрофилировав CRISPR – революционный инструмент для редактирования генов — для получения более полной картины, используя его для извлечения длинных «штрих–кодов» ДНК, которые могли бы более точно идентифицировать микробы, присутствующие в образце.
Лючия объяснила: “Собирая длинные ДНК-сигнатуры, уникальные для каждого типа микробов, и считывая их с помощью секвенирования ДНК, мы можем получить более четкое представление о существующих сообществах, давая биологам более полное представление об этих сложных микробных мирах”.
Это достижение еще более примечательно, учитывая, что оно стало результатом проекта Люсии на последнем курсе бакалавриата, который первоначально включал в себя тестирование подхода. После этого Мемориальный фонд Лив Сидзе Янсен предоставил Люсии грант на прохождение летней стажировки и разработку полноценной методологии исследования.
Соавтор исследования Кристофер Кэммиес, доцент кафедры биологических наук в Университете Бристоля, добавил: “Все это было бы невозможно без поддержки фонда, который помогает продвигать целый ряд исследований, ориентированных на охрану окружающей среды, и позволяет нам использовать ранние идеи и находки для более широкого воздействия”.
Старший автор исследования профессор Томас Гороховски, профессор биологической инженерии и научный сотрудник Королевского общества в Бристольском университете, сказал: “Не каждый день студенческий проект приводит к появлению нового захватывающего экспериментального метода. Все это стало возможным благодаря талантливому и целеустремленному студенту, увлеченному исследованиями в области окружающей среды, культуре совместных исследований в Школе биологических наук и широкой поддержке Мемориального фонда Лив Сидзе Янсен. Мне не терпится увидеть, как это исследование еще больше расширит наше понимание роли микробных сообществ в природе”.
Источник: Бристольский университет
